這一季的故事發生在上一季的3年后。這一季里，托尼（卡洛斯·博納德 Carlos Bernard 飾）和米歇爾（蕾可·艾爾絲沃斯 Reiko Aylesworth 飾）結婚了，并且成為了CTU的主管，而杰克（基弗·薩瑟蘭 Kiefer Sutherland 飾）的女兒金姆也加入CTU成為了一 名情報分析員。劇情由一具被扔在洛杉磯衛生中心外并感染了致命病毒的尸體開始。一個墨西哥毒梟為了讓美國政府釋放自己的哥哥，以致命病毒為恐嚇。杰克也因此又踏上了反恐調查之路。而這一季里面，杰克的調查并不順利，為了打入毒販內部，杰克不惜染上毒癮，這導致他在調查中困難重重。而白宮方面，獲得連任的鮑爾默總統（丹尼斯·海斯伯特 Dennis Haysbert 飾）康復后身邊多出了一位私人醫生女友，而總統的弟弟韋恩成為了他的得力助手，在連任壓力面前，又要化解這場生化危機?？偨y還能像前幾次那樣給予杰克強有力的支持嗎？
圣誕節前夕，波斯尼亞戰爭終于達成?；饏f議，亞得里亞海上的美軍官兵們即將返回家鄉。海軍領航員伯納中尉（Owen Wilson 飾）早已厭倦這場無意義的戰爭，長官萊斯利（Gene Hackman 飾）出面勸解卻無濟于事。圣誕當天，伯納與搭檔駕駛大黃蜂戰機執行航拍任務，無意中瞥見非安全區中有武裝人員行動，兩人決定介入，卻被對方的薩姆導彈擊落，搭檔被對方處死，伯納僥幸脫險，但對方搜尋人員沿路追蹤不舍。與此同時，接到伯納求救信息的萊斯利苦于北約將軍節制，在所謂顧全大局的考慮下無法介入非安全區搭救伯納，萊斯利只好借助媒體力量甚至不惜盜用盟友設備，展開了一場對落入敵后下屬的拯救行動。
冷戰結束后，天控局面臨被解散的危險，但是這個美國最大的特務機關，依舊擔負著重要的使命。不過，近期天控局總部卻遭受了突發性襲擊，導致特工們都有被身份曝光的危險。其中也包括強壯如牛、身手不凡的23號特工（道恩?強森 Dwayne Johnson 飾）?？偛拷涍^研究發現，襲擊事件是一個叫蓋不達集團的，為了迎敵，總部對分析家麥克斯韋（史蒂夫?卡瑞爾 Steve Carell 飾）委以重任，后者終于等到了一展身手的機會。于是，他積極參與了對付蓋不達的行動，不過之前的兩次演習都被他搞砸了。唯一的收獲是，他跟99號特工（安妮?海瑟薇 Anne Hathaway 飾）結成了搭檔，后者是唯一不怕身份曝光的特工。他們在飛機上遇到了一個疑似的恐怖分子，但是當他們出手時，卻意外陷入了對方的圈套。此后，這對歡喜冤家又接連遇到一系列令人啼笑皆非的困境……
Follows Iraqi war veteran Tes, as she prepares to strike back after a group of home invaders attack during her sister's bachelorette party, and she discovers that they are hellbent on not leaving any witnesses behind.